Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica
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Resumo
Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e
Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da
égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi
amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqiiéncias foram analisadas pelos
programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e célculo dos indices de diversidade
e riqueza pelo programa SPADE. A afiliaqio taxonémica foi feita pela submissfio das
seqfiéncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classifier do RDP II (Ribosomal
Database Project). A érvore filogenética foi construfda pelo método Neighbor Joining pelo
programa Mega, versfio 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas,
nos dois ambientes. O rio Solimées apresentou maior diversidade de géneros bacterianos.
enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior
concentraqio de OTUs penencentes a um género bacteriano especffico, Polynucleobacter,
acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bactérias nesses ambientes ainda pouco explorados.
Abstract
This study compared the structure of bacterial communities in the Solimoes rivers and
Black, based on ANELISE rRNA gene 168. 0 Total DNA was extracted after the fi ltraeio
mare through the fi lters of 0.8pM and 0.22uM respectively. 0 rRNA gene was 168
ampli fi ed by PCR. cloned and sequenced. and were analyzed by seqiiéncias
PHYLIP and DOTUR programs obtengio the OTUs. and CALCULATION of diversity indices
and wealth by SPADE program. The liaqio the taxonémica fi was made by the submissions of the fi
seq fi ences to BLASTn programs and naive Bayesian rRNA Classi fi er II RDP (Ribosomal
Database Project). The érvore fi logenética was construfda by Neighbor Joining method by
Mega program, vers Fi 4. 0s results showed a vast wealth of 01 'bacterial Us,
in both environments. The river Solimées showed greater diversity of bacterial genera.
while in the Black library, though less diverse, it found greater
concentraqio of OTUs penencentes a bacterial genus especf fi c, Polynucleobacter,
waving to a stronger investigaqio in order to understand the role of these bacteria in these still unexplored environments.
Descrição
Palavras-chave
Termo controlado
Bacia Amazônica; Rio Solimões; Rio Negro
Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS)
Citação
PEIXOTO, Jean Charles da Cunha. Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica. 2009. 132f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2009.
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